ImsVIEW

このプラグインについて

ImsVIEWは、同位体顕微鏡の測定データを扱うための「ImageJ」及び「Fiji」用プラグインです。

動作環境

ImageJがサポートするプラットフォーム上で動作するはずです。但し、次の制限があります。

• ImageJ Version1.39以降が動作すること。
• Java 1.6以降が動作すること。

最新バージョンの動作確認状況は次のとおりです。

使用条件

• ImsVIEW is licensed under a Creative Commons 2.1 License.
  クリエイティブ・コモンズ・ライセンスに準じます。
• 自由に使用してください。但し、無保証です。
• ソースコード・バイナリコード共に、複製、改変、頒布していただいて構いません。改変する場合は、クレジット表示を残してください。

ダウンロード （更新履歴、 全てのバージョン）

プラグインファイル（.jar）とソースコードを公開しています。

• Version 2021-0427rc（2021-04-27） ImsVIEW_.jar (source code)

  • LUT menuの不具合を修正しました。
  • 画像ファイルを開いたときに、そのファイルパス(Directory)を保持するようにしました。
  • Save Checked images as TIFFボタンを追加しました。ファイルリストでチェックマークを付けた画像を、それぞれのファイルパスにTIFF形式で保存します。

• Version 2012-1119（2012-11-19） ImsVIEW_.jar (source code)

  • Calc - Subtract STACK image 機能の追加
    • Subtract Top機能を追加しました。
  • インストール方法
  • 使用方法

• Version 2012-1030（2012-10-30） ImsVIEW_2012-1030.jar (source code)

  • 画像を開いた状態でImsVIEWプラグインを起動するとエラーが発生する不具合を修正しました。

• Version 2011-0725（2011-07-25） ImsVIEW_2011-0725_.jar (source code)

  • Calc - Subtract STACK image 機能の追加
    • integralを廃止しました。
    • NoiseReduction機能を追加しました。
    • Preferenceボタンを追加し、NRの幅とログ出力の有無を記憶するようにしました。
  • Calc - Correct Background 機能の追加
    • 時間(z軸)に対するBGの変動を補正しようとします。スタック画像にROIを指定してSubtract backgroundを押すと、z軸1単位ごとにROIの平均値を画像全体から減算し、新しいスタックを作ります。
  • Sync ROIの改善
    • Sync ROIにチェックが付いていると、新しく開いた画像にもROIが適用されるようにしました。
  • 2011-0721,0722はマイナートラブルがあるため、2011-0725への更新をお願いします。
• 上記以前のバージョンは、更新履歴をご覧ください。

関連するファイル

• Spyglass Transform互換 Look Up Table　Macintosh用 luts.zip, Windows用 luts_win.zip

  • 階調の一部（最下位と最上位）を修正したバージョンMacintosh用 luts2.zip, Windows用 luts_win2.zipを作りました。（2013-10-16）

その他

ImageJ用プラグインの開発方法

TODO

下記リクエストに応えられるよう、開発を継続しています。

• Lineのグラフを数値で出力する。（現状では、同じROIに対してPlot Profile [Ctrl+K]を実行しないと、Copy又はSaveすることができない）
• 複数画像間の演算機能。
• よく使う画像形式で「保存」するためのショートカット。（ImageJ標準機能のSaveを使うと深度32bitのtiff形式で保存され、この形式を開くことが出来るソフトウェアはImageJ以外に多くありません。File→Save as ...から形式を選んで保存することは可能です。）
• macro recorder対応。

連絡先

• 本ソフトウェアに関する問合せは、北海道大学 創成研究機構 産業利用拡大支援室（IIL)  の阿部へお願いします。